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Horiuchi Yuki, Makabe Koki, Laskaratou Danai, Hatori Kuniyuki, Sliwa Michel, Mizuno Hideaki, Hotta Jun-ichi

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Mutational analysis of the effects of N-glycosylation sites on the activity and thermal stability of rutinosidase from Aspergillus oryzae，ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY，161 110112，2022年11月

Koseki Takuya, Ishida Naoki, Hirota Ruka, Shiono Yoshihito, Makabe Koki

単著

GH-16 Type beta-1,3-Glucanase from Lysobacter sp. MK9-1 Enhances Antifungal Activity of GH-19 Type Chitinase, and Its Glucan-binding Domain Binds to Fungal Cell-wall，JOURNAL OF APPLIED GLYCOSCIENCE，69(3) 49-56，2022年

Otsuka Yuitsu, Sato Koki, Yano Shigekazu, Kanno Haruki, Suyotha Wasana, Konno Hiroyuki, Makabe Koki, Taira Toki

単著

Aspergillus oryzae Rutinosidase: Biochemical and Structural Investigation.，Applied and environmental microbiology，87(3) ，2021年01月

Makabe K, Hirota R, Shiono Y, Tanaka Y, Koseki T

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Cloning, expression, and characterization of a GH 19-type chitinase with antifungal activity from Lysobacter sp. MK9-1.，Journal of bioscience and bioengineering，131(4) 348-355，2020年12月

Yano S, Kanno H, Tsuhako H, Ogasawara S, Suyotha W, Konno H, Makabe K, Uechi K, Taira T

単著

Design, synthesis and evaluation of diaryl gamma-dihydropyrone derivatives as cyclocurcumin mimetics and inhibitors of the aggregation of amyloid beta，BIOORGANIC CHEMISTRY，104 104302，2020年11月

Hotsumi Mayumi, Tajiri Misato, Makabe Koki, Konno Hiroyuki

単著

Residue-Specific Binding Mechanisms of Thioflavin T to a Surface of Flat β-Sheets within a Peptide Self-Assembly Mimic.，Biochemistry，59(30) 2782-2787，2020年06月

Namioka S, Yoshida N, Konno H, Makabe K

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Cooperative unfolding of a single-layer beta-sheet protein, CPAP G-box，BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS，526(1) 105-109，2020年05月

Fujiwara Hideki, Shiga Shota, Makabe Koki

単著

Construction of a circularly connected VHH bispecific antibody (cyclobody) for the desirable positioning of antigen-binding sites，BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS，523(1) 72-77，2020年02月

Hemmi Saki, Asano Ryutaro, Kimura Kouki, Umetsu Mitsuo, Nakanishi Takeshi, Kumagai Izumi, Makabe Koki

単著

Structural insights into substrate recognition and catalysis by glycoside hydrolase family 87 alpha-1,3-glucanase from Paenibacillus glycanilyticus FH11，FEBS JOURNAL，287(12) 2524-2543，2019年12月

Itoh Takafumi, Intuy Rattanaporn, Suyotha Wasana, Hayashi Junji, Yano Shigekazu, Makabe Koki, Wakayama Mamoru, Hibi Takao

単著

Crystal structure of the catalytic unit of GH 87-type alpha-1,3-glucanase Agl-KA from Bacillus circulans，SCIENTIFIC REPORTS，9(1) 15295，2019年10月

Yano Shigekazu, Suyotha Wasana, Oguro Natsuki, Matsui Takashi, Shiga Shota, Itoh Takafumi, Hibi Takao, Tanaka Yoshikazu, Wakayama Mamoru, Makabe Koki

単著

Domain-Swapping Design by Polyproline Rod Insertion，CHEMBIOCHEM，20(19) 2454-2457，2019年10月

Shiga Shota, Yamanaka Masaru, Fujiwara Wataru, Hirota Shun, Goda Shuichiro, Makabe Koki

単著

beta-sheet elasticity of peptide self-assembly mimic, PSAM, with a grafted sequence characterized by comprehensive analyses of isomorphous crystals，JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS，290 ，2019年09月

Fujiwara Hideki, Hongo Kenta, Hori Yuki, Yoshida Norio, Makabe Koki

単著

Condensed desmin and actin cytoskeletal communication in lipid droplets，CYTOSKELETON，76(9-10) 477-490，2019年09月

Miyasaka Yoshiya, Murakami Keigo, Ito Koji, Kumaki Jiro, Makabe Koki, Hatori Kuniyuki

単著

Design, synthesis, and evaluation of a water soluble C5-monoketone type curcumin analogue as a potent amyloid beta aggregation inhibitor，BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS，29(16) 2157-2161，2019年08月

Hotsumi Mayumi, Tajiri Misato, Nikaido Yuri, Sato Taki, Makabe Koki, Konno Hiroyuki

単著

Grafting a short chameleon sequence from αB crystallin into a β-sheet scaffold protein，Proteins，2019年01月

Yuki Hori, Hideki Fujiwara, Wataru Fujiwara, Koki Makabe

共著（海外含む）

X-ray crystallographic analysis of the catalytic domain of alpha-1,3-glucanase FH1 from Paenibacillus glycanilyticus overexpressed in Brevibacillus choshinensis，ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS，74(Pt 12) 770-773，2018年12月

Intuy Rattanaporn, Itoh Takafumi, Suyotha Wasana, Hayashi Junji, Yano Shigekazu, Makabe Koki, Wakayama Mamoru, Hibi Takao

単著

Design, synthesis and evaluation of curcumin-based fluorescent probes to detect Aβ fibrils，Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters，28(22) 3520-3525，2018年10月

Sato T, Hotsumi M, Makabe K, Konno H

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Impact in stability during sequential CDR grafting to construct camelid VHH antibodies against zinc oxide and gold，J Biochem.，164(1) 21-25，2018年07月

3. Saito R, Saito Y, Nakazawa H, Hattori T, Kumagai I, Umetsu M, Makabe K

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An Overlapping Region between the Two Terminal Folding Units of the Outer Surface Protein A (OspA) Controls Its Folding Behavior，JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY，430(12) 1799-1813，2018年06月

Makabe Koki, Nakamura Takashi, Dhar Debanjan, Ikura Teikichi, Koide Shohei, Kuwajima Kunihiro

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Structural considerations for functional anti-EGFR × anti-CD3 bispecific diabodies in light of domain order and binding affinity，Oncotarget，164(1) 13884-13893，2018年02月

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Formation of the chaperonin complex studied by 2D NMR spectroscopy，PLoS One，12(10) e0187022，2017年10月

Takenaka T, Nakamura T, Yanaka S, Yagi-Utsumi M, Chandak MS, Takahashi K, Paul S, Makabe K, Arai M, Kato K, Kuwajima K.

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Role of Cys73 in the thermostability of farnesyl diphosphate synthase from Geobacillus stearothermophilus，3 Biotech，7 236，2017年

1. Petrus Yesaya Samori, Koki Makabe, Norimasa Ohya, Bunpei Hatano, Satoshi Murakami, Tatsuro Kijima

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Generation of camelid VHH bispecific constructs via in-cell intein-mediated protein trans-splicing.，Protein Engineering, Design & Selection，2016年11月

Shibuya Y, Haga N, Asano R, Nakazawa H, Hattori T, Takeda D, Sugiyama A, Kurotani R, Kumagai I, Umetsu M, Makabe K

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Dissection of the ATP-dependent conformational change cycle of a group II chaperonin.，J Mol Biol.，2014年

Nakagawa A, Moriya K, Arita M, Yamamoto Y, Kitamura K, Ishiguro N, Kanzaki T, Oka T, Makabe K, Kuwajima K, Yohda M.

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Structural insights into the stability perturbations induced by N-terminal variation in human and goat α-lactalbumin.，Protein Eng Des Sel.，2013年02月

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Native-state heterogeneity of β(2)-microglobulin as revealed by kinetic folding and real-time NMR experiments.，J Mol Biol.，2013年01月

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The catalytic domain of topological knot tRNA methyltransferase (TrmH) discriminates between substrate tRNA and non-substrate tRNA via an induced-fit process.，J Biol Chem. ，2013年

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ATP dependent rotational motion of group II chaperonin observed by X-ray single molecule tracking.，PLoS One ，2013年

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NMR characterization of the interaction of GroEL with amyloid β as a model ligand.，FEBS Lett. ，2013年

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Molecular mechanisms of the cytotoxicity of human α-lactalbumin made lethal to tumor cells (HAMLET) and other protein-oleic acid complexes.，J Biol Chem.，2013年

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Fibrillogenic propensity of the GroEL apical domain: A Janus-faced minichaperone，FEBS Letters，2012年04月

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Dissecting a Bimolecular Process of MgATP2- Binding to the Chaperonin GroEL，J Mol Biol，2011年07月

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Flexible recognition of the tRNA G18 methylation target site by TrmH methyltransferase through first binding and induced fit processes.，J Biol Chem，2010年03月

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Molecular Mechanism of Thioflavin-T Binding to the Surface of beta-Rich Peptide Self-Assemblies.，J Mol Biol，2009年01月

Biancalana M, Makabe K, Koide A, Koide S

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The promiscuity of beta-strand pairing allows for rational design of beta-sheet face inversion.，J Am Chem Soc，2008年11月

Makabe K, Koide S

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Aromatic cross-strand ladders control the structure and stability of beta-rich peptide self-assembly mimics.，J Mol Biol，2008年10月

Biancalana M, Makabe K (Equal contribution with the 1st author), Koide A, Koide S

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Design of protein function leaps by directed domain interface evolution.，Proc Natl Acad Sci U S A，2008年05月

Huang J, Koide A, Makabe K, Koide S

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High-resolution structure of a self-assembly-competent form of a hydrophobic peptide captured in a soluble beta-sheet scaffold.，J Mol Biol，2008年04月

Makabe K, Biancalana M, Yan S, Tereshko V, Gawlak G, Miller-Auer H, Meredith SC, Koide S

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Thermodynamic consequences of mutations in Vernier zone residues of a humanized anti-human epidermal growth factor receptor (EGFR) murine antibody, 528.，J Biol Chem，2008年01月

Makabe K, Nakanishi T, Tsumoto K, Tanaka Y, Kondo H, Umetsu M, Sone Y, Asano R, Kumagai I

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b-Strand flipping and slipping triggered by turn replacement reveal the opportunistic nature of b-strand pairing.，J Am Chem Soc，2007年11月

Makabe K, Yan S, Tereshko V, Gawlak G, Koide S

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Human CD4+ central and effector memory T cells produce IL-21: effect on cytokine-driven proliferation of CD4+ T cell subsets.，Int. Immunol，2007年10月

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High IL-21 receptor expression and apoptosis induction by IL-21 in follicular lymphoma. ，Cancer Lett，2007年10月

Akamatsu N, Yamada Y, Hasegawa H, Makabe K, Asano R, Kumagai I, Murata K, Imaizumi Y, Tsukasaki K, Tsuruda K, Sugahara K, Atogami S, Yanagihara K, Kamihira S

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Hydrophobic Surface Burial Is the Major Stability Determinant of a Flat, Single-layer beta-Sheet. ，J Mol Biol，2007年04月

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Atomic-resolution crystal structure of Borrelia burgdorferi outer surface protein A via surface engineering.，Protein Science，2006年08月

Makabe K, Tereshko V, Gawlak G, Yan S, Koide S

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Humanization of the bispecific epidermal growth factor receptor x CD3 diabody and its efficacy as a potential clinical reagent. ，Clin Cancer Res，2006年07月

Asano R, Sone Y, Makabe K, Tsumoto K, Hayashi H, Katayose Y, Unno M, Kudo T, Kumagai I

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Tumor-directed lymphocyte-activating cytokines: refolding-based preparation of recombinant human interleukin-12 and an antibody variable domain-fused protein by additive-introduced stepwise dialysis. ，Biochem Biophys Res Commun，2005年03月

Makabe K, Asano R, Ito T, Tsumoto K, Kudo T, Kumagai I

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A highly effective and stable bispecific diabody for cancer immunotherapy: cure of xenografted tumors by bispecific diabody and T-LAK cells. ，Cancer Immunol Immunother，2004年06月

Hayashi H, Asano R, Tsumoto K, Katayose Y, Suzuki M, Unno M, Kodama H, Takemura S, Yoshida H, Makabe K, Imai K, Matsuno S, Kumagai I, Kudo T

共著（海外含む）

Efficient construction of a diabody using a refolding system: anti-carcinoembryonic antigen recombinant antibody fragment.，J Biochem (Tokyo)，2002年12月

Asano R, Kudo T, Nishimura Y, Makabe K, Hayashi H, Suzuki M, Tsumoto K, Kumagai I

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Antitumor activity of interleukin-21 prepared by novel refolding procedure from inclusion bodies expressed in Escherichia coli.，FEBS Lett，2002年09月

Asano R, Kudo T, Makabe K (Equal contribution with the 1st author), Tsumoto K, Kumagai I

共著（海外含む）

挑戦的萌芽研究，2014年04月 ～ 2016年03月，蛋白質ライゲーションによる網羅的な二重特異性抗体の作製と革新的分子の単離

特別推進研究，2012年04月 ～ 2017年03月，ナノ空間インターフェイスのバイオデザイン(分担)

若手研究(B)，2011年04月 ～ 2014年03月，溶媒クエンチ法と蛋白質工学の融合による巨大蛋白質複合体の構造揺らぎ解析

2022年度，物理化学入門

2021年度，生物機能工学特論

2021年度，生物機能工学特論

2021年度，卒業研究

2021年度，エンジニアリング創成

2021年度，卒業研究

2021年度，エンジニアリング創成

2021年度，物理化学入門

2020年度，システム創成工学基礎及び実験

2020年度，生物機能工学特論

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2018年度，生化学Ⅱ

2018年度，システム創成入門

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2014年度，生物機能工学特論

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2013年度，線形代数

2013年度，物理化学入門

2013年度，スタートアップセミナー（工学部・システム創成工学科）